近日，复旦大学上海医学院徐彦辉研究团队再次在基因转录领域取得重要突破，继2023年底系统描绘了RNA聚合酶Ⅱ转录起始连续动态全过程后，再次揭示了RNA聚合酶转录起始动态过程。这一最新研究也为我们逐步打开基因转录过程的“黑匣子”，理解生命科学的复杂与精妙提供了新的视角。RNA聚合酶（RNAPs）是转录的核心酶，负责将DNA上的遗传信息转录为RNA。在哺乳动物中，RNA聚合酶进化出三种功能分化的形式：Pol I、Pol II和Pol III。其中，Pol II负责转录编码蛋白质的mRNA，由于其与基因表达调控密切相关，长期以来一直是转录研究的重点对象。相比之下，Pol III主要转录多种短链非编码RNA（如5S rRNA、tRNA和U6 snRNA等），在蛋白质合成、RNA剪接以及细胞周期调控中发挥关键作用。2025年6月4日，复旦大学上海医学院徐彦辉研究团队在《自然》（Nature）杂志在线发表题为“Structural insights into human Pol III transcription initiation in action”的研究论文。该研究重建了人源Pol III

少突胶质细胞（Oligodendrocyte，OL）在中枢神经系统中负责生成包绕神经元轴突的髓鞘，正常的髓鞘结构对于神经元的生理活动至关重要。少突胶质细胞发育异常与多种中枢神经系统疾病密切相关。然而，少突胶质细胞发育过程中的分子调控机制，特别是可变剪接（Alternative Splicing，AS）在其中发挥的作用，尚未完全探明。　　2025年5月29日，复旦大学脑科学研究院/脑功能与脑疾病全国重点实验室陈献华课题组在《核酸研究》（Nucleic Acids Research）杂志上发表以《SRSF10通过调节前体mRNA可变剪接在小鼠中枢神经系统发育过程中调控少突胶质细胞的分化过程》（“SRSF10 regulates oligodendrocyte differentiation during mouse central nervous system development by modulating pre-mRNA splicing”）为题的研究论文。研究首先发现SRSF10的蛋白表达水平在小鼠少突胶质细胞分化初期显著升高，而在成年小鼠的成熟少突胶质细胞中较低。随后，作者利用

乙肝病毒（HBV）感染是全球范围内重要的公共卫生问题，约有2.4亿人处于慢性感染状态，长期可进展为肝硬化及肝细胞癌，每年导致超过65万人死亡。HBV感染的肝细胞除产生完整病毒外，还大量分泌不具感染性的HBsAg亚病毒颗粒，其数量可达完整病毒的100～1000倍。在急性感染自限性清除过程中，HBsAg通常会从血液中完全消失，并伴随产生抗-HBs抗体。临床上，HBsAg的持续性清除（无论是否伴随抗-HBsAg产生）被视为慢性乙型肝炎“功能性治愈”的关键标志。然而，现有抗病毒治疗手段难以有效清除HBsAg，因而难以实现功能性治愈。因此，深入理解HBV感染过程中机体如何清除HBsAg，可能为根除慢性感染提供新的治疗策略和靶点。T细胞介导的免疫应答在病毒清除中发挥关键作用，其中CD8+T细胞是主要的效应细胞，而CD4+T细胞不仅通过辅助功能协调CD8+T细胞和B细胞应答，还能直接发挥抗病毒效应。T细胞应答的有效启动依赖于专职抗原递呈细胞（APCs）对病毒抗原的递呈。目前对于病毒抗原递呈路径的认识主要来自对组织嗜性广泛的模式病毒或含佐剂疫苗的研究。与这些情形不同，HBV具有高度的肝细胞嗜性，仅感染

PD-1/PD-L1抑制剂在晚期高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）中的单药客观缓解率不足15%，提示其肿瘤微环境存在独特免疫逃逸特征。研究发现肿瘤相关中性粒细胞（TAN）具有双重调控特性：既通过促血管生成及T细胞抑制促进肿瘤进展，又具备向抗肿瘤表型转化的可塑性。临床证据显示，外周血中性粒细胞/淋巴细胞比值（NLR）升高与ICB疗效负相关，而TAN表面PD-L1等免疫检查点分子的表达提示其可作为联合治疗靶点。课题组前期发现JAG2+TAN亚群与HGSOC不良预后显著相关，机制研究表明Notch抑制剂LY3039478可阻断该亚群的免疫抑制作用并增强CD8+T细胞活性。但JAG2+TAN介导免疫逃逸的分子机制及其对肿瘤微环境的重编程作用，仍是优化ICB联合策略亟待解决的关键科学问题。2025年3月22日，复旦大学附属妇产科医院刘海鸥研究员团队在Cancer Communications杂志上在线发表了题为Immunosuppressive JAG2+ tumor-associated neutrophils hamper PD-1 blockade response in ovarian c

近日，复旦大学附属眼耳鼻喉科医院基因治疗团队领衔发现基因治疗后听觉皮层的动态神经重塑过程及儿童发育变化，该最新研究成果发表在《自然-人类行为》（Nature Human Behaviour），题为《基因治疗后DFNB9儿童听觉皮层激活和发育提升的初步证据》（“Preliminary evidence for enhanced auditory cortex activation and mental development after gene therapy in children with autosomal recessive deafnes”）。基因治疗团队在《自然-人类行为》发表论著该研究由复旦大学附属眼耳鼻喉科医院联合南方科技大学、复旦大学附属儿科医院共同完成。接受AAV-hOTOF基因治疗的先天性耳聋儿童，通过功能性近红外光谱（fNIRS）与脑电（EEG）等技术，研究首次在中枢层面证实了基因治疗后听觉通路功能的重建，揭示了基因治疗后听觉皮层的动态神经重塑过程及儿童发育变化，为先天性耳聋的精准化治疗策略提供了关键科学依据。fNIRS数据显示，基因治疗后受试者听觉皮层在音乐和

嵌合抗原受体修饰T细胞（CAR-T）疗法已在血液系统肿瘤治疗中取得显著疗效，但其对实体瘤的临床应用仍面临重大挑战。CAR-T细胞依赖糖酵解和线粒体氧化磷酸化（OXPHOS）供能，极易受制于低糖、缺氧及乳酸蓄积的实体瘤微环境，陷入能量枯竭-功能耗竭的恶性循环。而调节性T细胞（Treg）因其独特的脂代谢优势可在实体瘤微环境中长期存活并发挥效应，为破解CAR-T细胞实体瘤治疗困局提供关键启示。 2025年5月5日，复旦大学生物医学研究院/基础医学院储以微教授、复旦大学附属华山医院骆菲菲研究员团队在Cell Metabolism发表题为“Foxp3 confers long-term efficacy of chimeric antigen receptor-T cells via metabolic reprogramming”的研究论文，首次揭示Foxp3通过非转录依赖的线粒体动态调控机制，重塑CAR-T细胞代谢表型，赋予其突破实体瘤微环境限制的生存优势，提升CAR-T细胞实体瘤治疗的持久性和有效性。这项研究为实体瘤免疫治疗提供了增效不增毒的创新解决方案。该研究构建了共表达Treg核心转录

在肿瘤发生发展过程中，抑癌基因启动子区的CpG岛常发生异常高甲基化修饰，进而通过招募DNA甲基化阅读器以强化转录沉默，导致细胞增殖失控并促进肿瘤进展。因此，靶向DNA甲基化阅读器以逆转基因沉默成为当前癌症治疗领域备受关注的研究方向。在多种DNA甲基化阅读器中，甲基化CpG结合域（MBD）蛋白家族发挥着关键作用。其中，MBD2不仅是核小体重塑和组蛋白去乙酰化酶（NuRD）复合体的核心组分，还具有特异性识别甲基化DNA的能力。临床研究表明，MBD2在神经胶质瘤、宫颈癌、胰腺癌等多种人类恶性肿瘤中普遍呈现高表达状态，且其表达水平与肿瘤的生长转移密切相关。然而，MBD2蛋白水平上调与肿瘤发生发展的病理学关联尚未完全阐明，MBD2如何通过整合NuRD复合体来调控肿瘤细胞的表观遗传特征也有待深入研究。2025年4月30日，复旦大学生物医学研究院温文玉课题组在Nature Cell Biology杂志上发表了题为“Targeting redox-sensitive MBD2–NuRD condensate in cancer cells”的研究论文。该研究揭示了MBD2通过形成相分离凝聚体组装并激活

增强子是关键的远端表观元件，激活状态的增强子会转录出一段非编码RNA，即增强子RNA（eRNA），它们在基因表达调控中扮演着至关重要的角色。eRNA具有较高的组织和细胞特异性，且与肿瘤微环境中免疫细胞的浸润密切相关。同时，eRNAs与多种抗癌药物的敏感性存在联系。系统地研究eRNAs在癌症免疫治疗中的功能，对于在大规模癌症患者中筛选联合治疗药物具有重要意义。2025年4月15日，复旦大学基础医学院生化系/代谢分子医学教育部重点实验室的张朝团队与病理系的刘秀萍教授、王宇翔青年研究员合作在Cancer Research上发表了题为Characterization of an Enhancer RNA Signature Reveals Treatment Strategies for Improving Immunotherapy Efficacy in Cancer的研究，利用eRNA在肿瘤免疫微环境中的特性，建立了eRNA免疫治疗预测分数eRNA immunotherapy signature (eRIS)，eRIS可以用来表征免疫治疗的反应率和预测提高免疫治疗反应的联用药物，表现出良

以丘脑底核（Subthalamic nucleus, STN）为靶点的高频深部脑刺激（Deep brain stimulation, DBS）是一种治疗中晚期帕金森病（Parkinsons disease, PD）的有效手段。然而，DBS的具体作用机制是什么、为什么高频刺激才有疗效等关键科学问题尚未阐明。深入研究DBS的神经机制将为优化DBS刺激模式与参数、提升临床疗效提供重要理论依据。2025年4月19日，复旦大学脑科学转化研究院舒友生课题组在《自然-通讯》（Nature Communications）上发表了题为“Deep brain stimulation alleviates Parkinsonian motor deficits through desynchronizing GABA release in mice”的研究论文。该研究首次揭示了GABA递质的非同步化释放（Asynchronous release, AR）模式在高频DBS治疗中的关键作用，从细胞、突触及神经环路层面系统解析了STN-DBS的神经机制，为优化帕金森病临床治疗提供了新方向。研究表明，帕金森病患者的

p53是关键的抑癌蛋白，通过调控细胞周期和DNA损伤修复抑制肿瘤发生,其功能受到多种翻译后修饰的精细调控。脱酰胺化修饰是一种特殊的翻译后修饰，指在酶的催化下，使天冬酰胺（Asn）或谷氨酰胺（Gln）残基发生脱氨转化为带负电荷的天冬氨酸（Asp）或谷氨酸（Glu），从而不可逆地改变蛋白功能。系列研究表明，蛋白质异常脱酰胺可能导致诸如严重退行性疾病、阿尔茨海默病和白内障等疾病,但p53是否受脱酰胺化调控及其生物学意义尚不明确。近日，复旦大学附属妇产科医院、代谢与整合生物学研究院王红艳教授团队在国际学术期刊《细胞研究》（Cell Research）上发表题为“Pyrimidine synthase CAD deamidates and inactivates p53”的研究，揭示了p53的一种新的翻译后修饰，脱酰胺化修饰。该研究通过转录组学、代谢组学等分析发现，谷氨酰胺拮抗剂6-重氮-5-氧代-L-正亮氨酸（6-Diazo-5-oxo-L-norleucine，DON）显著抑制嘧啶从头合成限速酶氨基甲酰磷酸合成酶2-天冬氨酸转氨甲酰酶-二氢乳清酶（Carbamoyl Phosphate Sy

4月14日，复旦大学附属肿瘤医院余科达教授团队在《美国科学院院刊》（PNAS）发表了一项研究，揭示了基因SNX10缺乏导致HER2（人表皮生长因子受体2）囊泡运输异常，进而引起抗HER2 ADC（抗体偶联药物）治疗发生耐药的新机制。这为优化临床用药方案、提高患者获益提供了新的理论依据，并为开发新的HER2阳性乳腺癌ADC药物治策略提供新的潜在靶点。乳腺癌是影响全球女性健康的最常见恶性肿瘤之一。其中人表皮生长因子受体2（HER2）阳性乳腺癌约占所有乳腺癌的20%。抗体偶联药物（ADC）作为一种新型靶向药物（如T-DXd德曲妥珠单抗、T-DM1恩美曲妥珠单抗），兼具细胞毒性与抗体靶向特异性，在HER2阳性乳腺癌治疗中表现出显著疗效。然而，随着其临床应用，ADC的耐药和抵抗已成为HER2阳性乳腺癌治疗新挑战。深入探究抗HER2 ADC的耐药机制，筛选关键基因并阐明其作用机制，对逆转耐药、优化临床用药、提高患者获益具有重要意义。为探究该耐药机制特征，余科达教授团队开展深入研究。通过联合分析复旦大学附属肿瘤医院乳腺外科的人乳腺癌来源PDO样本、I-SPY2临床试验T-DM1治疗组，以及体外诱导的

2025年4月14日，复旦大学附属口腔医院蒋欣泉教授、周名亮副研究员团队在ACS Nano上发表了题为“Engineered Macrophage Membrane-Camouflaged Nanodecoys Reshape the Infectious Microenvironment for Efficient Periodontitis Treatment”的研究论文。该研究通过基因重组等技术，开发了一种新型的抗菌肽修饰巨噬细胞膜仿生纳米诱饵，兼具“靶向杀菌”、“改善牙周乏氧环境”、“清除过量ROS”、“扭转巨噬细胞促炎-促修复失衡表型”功能，通过靶向干预“牙周致病菌-免疫应激”病理性正反馈，重塑牙周稳态，实现高效牙周组织再生，可望为革新牙周炎治疗范式提供参考。论文地址：https://doi.org/10.1021/acsnano.4c14305

2025年3月31日，复旦大学基础医学院免疫学系魏园园团队在《循环研究》(Circulation Research)期刊在线发表了题为“Srsf3-Dependent APA Drives Macrophage Maturation and Limits Atherosclerosis”的研究论文并被选为封面文章。该研究首次阐明，Srsf3依赖的长3′UTR异构体生成可通过维持线粒体蛋白翻译促进巨噬细胞功能成熟，进而增强其清除内吞物的能力，最终在动脉粥样硬化进程中发挥保护性作用。研究团队首先运用单细胞RNA测序技术，在小鼠动脉粥样硬化斑块中发现了一个具有独特转录特征的过渡态巨噬细胞亚群，该亚群在单核细胞向巨噬细胞分化的动态过程中扮演着关键的桥梁角色。进一步研究发现，作为mRNA选择性剪切和可变多聚腺苷酸化过程的核心调控因子，Srsf3的表达缺失会显著影响这一分化进程。在构建髓系特异性Srsf3敲除的动脉粥样硬化小鼠模型后，研究人员发现未成熟过渡态巨噬细胞亚群在斑块中异常累积，并伴随动脉粥样硬化病变程度的显著加重。病理机制研究表明，Srsf3缺失导致巨噬细胞滞留在功能缺陷的过渡状态，胞噬

4月10日，复旦大学附属肿瘤医院邵志敏教授领衔团队发布的一项研究显示，该团队在前期开展的HER2阳性乳腺癌新辅助精准治疗临床试验基础上，结合数字病理和空间组学技术，首次系统揭示了影响新一代抗HER2 ADC（抗体-药物偶联物）药物疗效的肿瘤空间特征，并利用人工智能方法构建了首个可以预测新一代抗HER2 ADC药物疗效的实用模型，为这类新型抗肿瘤药物的精准应用提供了有力参考工具。国际学术期刊《癌细胞》（Cancer Cell）在线发表了这项重要成果，并同期配发评述，称该研究“向着ADC的精准应用迈出了重要一步”（represents a significant step toward ADC precision therapy）。 抗肿瘤“魔法子弹”亟需疗效预测实用工具 乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一，根据分子特征可以细分为多种亚型。其中，HER2阳性乳腺癌是一类以HER2基因扩增和过表达为特征的分子亚型，约占所有乳腺癌的15~20%，具有侵袭性强、易复发转移的特点。 肿瘤医院乳腺外科主任兼大外科主任邵志敏教授说，HER2即“人表皮生长因子受体-2”，是乳腺癌重要的驱动基因和预后指标，